En el Instituto se han desarrollado numerosos programas de investigación:

2001/2004 Proyecto CIUNT H2O7 “Marcos conceptuales legitimadores de una nueva racionalidad", dirigido por la Dra. Cristina Bulacio.

2005/ 2008 Proyecto de Investigación CIUNT 26-H305 “Antropología Siglo XXI. Nuevas construcciones de la razón”, dirigido por la Dra. Cristina Bulacio.

2008/ 2013 Proyecto de Investigación CIUNT 26-H407 “Antropología Siglo XXI. Nuevas construcciones de la razón”, dirigido por la Dra. Cristina Bulacio

En la actualidad depende del Instituto el proyecto de Investigación PIUNT 26H527  Identidad, inclusión, exclusión, dirigido por el Dr. Raúl Nader (2013/2018)